클로이의 데이터

Trim Galore는 fastaq 리드 파일에서 adapter trimming과 quality trimming 할 수 있는 편리한 프로그램입니다. adapter trimming 기능을 이용해서 polyA 서열 또한 제거를 할 수 있는데요, 옵션은 다음과 같습니다. -a/--adapter Adapter sequence to be trimmed. If not specified explicitly, Trim Galore will try to auto-detect whether the Illumina universal, Nextera transposase or Illumina small RNA adapter sequence was used. Also see --illumina, --nextera and --s..

EMBOSS 프로그램은 sequence analysis를 위한 다양한 툴을 제공하고있습니다. 그중에서 Sequence Format Conversion기능의 seqret으로 fastq 파일을 fasta로 변환하는 방법에 대해 소개하려합니다. 우선 EMBOSS 프로그램이 없으면 아래 링크를 통해 다운로드를 받아주세요. 다운로드 후에는 압축을 풀면 특별한 설치 과정없이 바로 사용이 가능합니다. EMBOSS Downloads EMBOSS Downloads Contents The EMBOSS package is available from our new FTP server ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/ in the file EMBOSS-6.5.7.tar.gz This distr..

https://ggdc.dsmz.de/ggdc.php# https://ggdc.dsmz.de/ggdc.php note: the e-mail delivery was interrupted yesterday (January 14th) from 5pm (CET) till today (January 15th) 6am (CET), due to a campus-wide e-mail server problem. In case you did not receive a result notification, please re-run your job. We are sorry for t ggdc.dsmz.de Genoem to Genome Distance Calculator(GGDC) - Genome 간의 거리를 간편하게 계산해..

CVTree3(Composition Vector Tree)웹 프로그램을 이용한 Phylogenetic tree분석에 대해서 이야기해보려합니다. CVTree 3.0 CVTree3: Composition Vector Tree Version 3 Description: CVTree constructs whole-genome based phylogenetic trees without sequence alignment by using a Composition Vector (CV) approach. It was first developed to infer evolutionary relatedness of microbial or tlife.fudan.edu.cn 해당 프로그램은 두가지 타입의 인풋 파일을 받습니다. 하..