클로이의 데이터

Trim Galore는 fastaq 리드 파일에서 adapter trimming과 quality trimming 할 수 있는 편리한 프로그램입니다. adapter trimming 기능을 이용해서 polyA 서열 또한 제거를 할 수 있는데요, 옵션은 다음과 같습니다. -a/--adapter Adapter sequence to be trimmed. If not specified explicitly, Trim Galore will try to auto-detect whether the Illumina universal, Nextera transposase or Illumina small RNA adapter sequence was used. Also see --illumina, --nextera and --s..

https://ggdc.dsmz.de/ggdc.php# https://ggdc.dsmz.de/ggdc.php note: the e-mail delivery was interrupted yesterday (January 14th) from 5pm (CET) till today (January 15th) 6am (CET), due to a campus-wide e-mail server problem. In case you did not receive a result notification, please re-run your job. We are sorry for t ggdc.dsmz.de Genoem to Genome Distance Calculator(GGDC) - Genome 간의 거리를 간편하게 계산해..

pheatmap을 이용해서 clustering된 heatmap을 그리는 방법 (본 포스팅에 사용된 데이터 셋은 위 링크를 통해 받을 수 있습니다.) # 목표 히트맵 1. Importing Test Data > myData myData %>% dim [1] 15 15 > myData %>% head A B C D E F G H I J K L M N O A 100.0 79.7 79.8 80.6 80.4 80.9 80.0 79.9 79.1 94.6 79.7 94.7 95.0 95.0 78.8 B 79.7 100.0 84.8 84.7 84.3 86.0 92.0 85.3 83.6 80.3 85.0 79.8 79.8 78.7 85.3 C 79.8 84.8 100.0 88.9 90.7 90.9 84.7 88.8 85..

CVTree3(Composition Vector Tree)웹 프로그램을 이용한 Phylogenetic tree분석에 대해서 이야기해보려합니다. CVTree 3.0 CVTree3: Composition Vector Tree Version 3 Description: CVTree constructs whole-genome based phylogenetic trees without sequence alignment by using a Composition Vector (CV) approach. It was first developed to infer evolutionary relatedness of microbial or tlife.fudan.edu.cn 해당 프로그램은 두가지 타입의 인풋 파일을 받습니다. 하..