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Bioinformatics | TrimGalore를 이용하여 polyA제거하기

Trim Galore는 fastaq 리드 파일에서 adapter trimming과 quality trimming 할 수 있는 편리한 프로그램입니다. adapter trimming 기능을 이용해서 polyA 서열 또한 제거를 할 수 있는데요, 옵션은 다음과 같습니다. -a/--adapter Adapter sequence to be trimmed. If not specified explicitly, Trim Galore will try to auto-detect whether the Illumina universal, Nextera transposase or Illumina small RNA adapter sequence was used. Also see --illumina, --nextera and --s..

Bioinformatics 2020. 4. 1. 17:40
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